サンプル配列

様々な解析を試すための配列の例として、血圧調節に重要な役割を担うアンギオテンシノーゲン遺伝子のDNA配列とアンギオテンシ1型受容体遺伝子のアミノ酸配列を用意しました。以下の配列をコピーし、解析用のボックスに貼り付けて解析ボタンを押してください。


アンギオテンシノーゲン遺伝子のDNA配列

0001 gtgcacaggc agcctgggaa cagctccatc cccacccctc agctataaat agggcatcgt
0061 gacccggccg ggggaagaag ctgccgttgt tctgggtact acagcagaag ggtatgcgga
0121 agcgagcacc ccagtctgag atggctcctg ccggtgtgag cctgagggcc accatcctct
0181 gcctcctggc ctgggctggc ctggctgcag gtgaccgggt gtacatacac cccttccacc
0241 tcgtcatcca caatgagagt acctgtgagc agctggcaaa ggccaatgcc gggaagccca
0301 aagaccccac cttcatacct gctccaattc aggccaagac atcccctgtg gatgaaaagg
0361 ccctacagga ccagctggtg ctagtcgctg caaaacttga caccgaagac aagttgaggg
0421 ccgcaatggt cgggatgctg gccaacttct tgggcttccg tatatatggc atgcacagtg
0481 agctatgggg cgtggtccat ggggccaccg tcctctcccc aacggctgtc tttggcaccc
0541 tggcctctct ctatctggga gccttggacc acacagctga caggctacag gcaatcctgg
0601 gtgttccttg gaaggacaag aactgcacct cccggctgga tgcgcacaag gtcctgtctg
0661 ccctgcaggc tgtacagggc ctgctagtgg cccagggcag ggctgatagc caggcccagc
0721 tgctgctgtc cacggtggtg ggcgtgttca cagccccagg cctgcacctg aagcagccgt
0781 ttgtgcaggg cctggctctc tatacccctg tggtcctccc acgctctctg gacttcacag
0841 aactggatgt tgctgctgag aagattgaca ggttcatgca ggctgtgaca ggatggaaga
0901 ctggctgctc cctgatggga gccagtgtgg acagcaccct ggctttcaac acctacgtcc
0961 acttccaagg gaagatgaag ggcttctccc tgctggccga gccccaggag ttctgggtgg
1021 acaacagcac ctcagtgtct gttcccatgc tctctggcat gggcaccttc cagcactgga
1081 gtgacatcca ggacaacttc tcggtgactc aagtgccctt cactgagagc gcctgcctgc
1141 tgctgatcca gcctcactat gcctctgacc tggacaaggt ggagggtctc actttccagc
1201 aaaactccct caactggatg aagaaactat ctccccggac catccacctg accatgcccc
1261 aactggtgct gcaaggatct tatgacctgc aggacctgct cgcccaggct gagctgcccg
1321 ccattctgca caccgagctg aacctgcaaa aattgagcaa tgaccgcatc agggtggggg
1381 aggtgctgaa cagcattttt tttgagcttg aagcggatga gagagagccc acagagtcta
1441 cccaacagct taacaagcct gaggtcttgg aggtgaccct gaaccgccca ttcctgtttg
1501 ctgtgtatga tcaaagcgcc actgccctgc acttcctggg ccgcgtggcc aacccgctga
1561 gcacagcatg aggccagggc cccagaacac agtgcctggc aaggcctctg cccctggcct
1621 ttgaggcaaa ggccagcagc agataacaac cccggacaaa tcagcgatgt gtcaccccca
1681 gtctcccacc ttttcttcta atgagtcgac tttgagctgg aaagcagccg tttctccttg
1741 gtctaagtgt gctgcatgga gtgagcagta gaagcctgca gcggcacaaa tgcacctccc
1801 agtttgctgg gtttatttta gagaatgggg gtggggaggc aagaaccagt gtttagcgcg
1861 ggactactgt tccaaaaaga attccaaccg accagcttgt ttgtgaaaca aaaaagtgtt
1921 cccttttcaa gttgagaaca aaaattgggt tttaaaatta aagtatacat ttttgcattg
1981 ccttcggttt gtatttagtg tcttgaatgt aagaacatga cctccgtgta gtgtctgtaa
2041 taccttagtt ttttccacag atgcttgtga tttttgaaca atacgtgaaa gatgcaagca
2101 cctgaatttc tgtttgaatg cggaaccata gctggttatt tctcccttgt gttagtaata
2161 aacgtcttgc cacaataagc ctccaaaaaa aa



アンギオテンシン1型受容体遺伝子のアミノ酸配列

001 milnsstedg ikriqddcpk agrhnyifvm iptlysiifv vgifgnslvv iviyfymklk
061 tvasvfllnl aladlcfllt lplwavytam eyrwpfgnyl ckiasasvsf nlyasvfllt
121 clsidrylai vhpmksrlrr tmlvakvtci iiwllaglas lpaiihrnvf fientnitvc
181 afhyesqnst lpiglgltkn ilgflfpfli iltsytliwk alkkayeiqk nkprnddifk
241 iimaivlfff fswiphqift fldvliqlgi irdcriadiv dtampitici ayfnnclnpl
301 fygflgkkfk ryflqllkyi ppkakshsnl stkmstlsyr psdnvssstk kpapcfeve


RFLP(制限酵素多型)用のサンプル配列

煙草の発がん性物質の代謝に関わるCUPIA1遺伝子のMspI多型を判別するPCRプライマーとそれによって増幅される配列。



CYPIA1遺伝子のMspI多型を判別する342 bpを増やすPrimer

プライマー1 AGGAGTCTTGTCTCATGCCTGTAATCCCAG
プライマー2 CAGTGAAGAGGTGTAGCCGCTGCACTTAAG



MspIで切断されないタイプ(342 bp)
→ CYPIA1の活性が低い

AGGAGTCTTGTCTCATGCCTGTAATCCCAGcactttgggaggctgaggcaggtggatcac
ttgagctcaggagtttgagaccagcctgggcaacatggtgaaaccccatctctacaaaaa
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagctgtggtggcgtgtgcctgcggccccaactactcagag
gctgaggtgggagaatcgtgtgagccc
Aggaggtggaggttacagtgaaacaaaatggta
ccagtgcactccagcctggatgacctggggaccctgtctcaaaaaatagagtcttgtccc
tcaaacagactgCTTAAGTGCAGCGGCTACACCTCTTCACTG



MspIで切断されるタイプ(136 + 206 bp)
→ CYPIA1の活性が高く肺がんリスク高

AGGAGTCTTGTCTCATGCCTGTAATCCCAGcactttgggaggctgaggcaggtggatcac
ttgagctcaggagtttgagaccagcctgggcaacatggtgaaaccccatctctacaaaaa
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagctgtggtggcgtgtgcctgcggccccaactactcagag
gctgaggtgggagaatcgtgtgagccc
Gggaggtggaggttacagtgaaacaaaatggta
ccagtgcactccagcctggatgacctggggaccctgtctcaaaaaatagagtcttgtccc
tcaaacagactgCTTAAGTGCAGCGGCTACACCTCTTCACTG