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研究解析ツール サンプル配列 使用方法
以下のボックスにキーワードを入力し、目的の検索ボタンを押してください。

文献検索 
DNA情報検索
タンパク質情報検索
疾病及び総合検索

以下のボックスにDNA配列またはアミノ酸配列を入力し、目的の解析ボタンを押してください。
DNA配列解析用は青で、タンパク質解析用は緑で色分けしています。)

 







長さ=bp Tm値= GC含量= 分子量=
 

 直鎖  環状

       
            

Detection Sequencing
PCR primer
検索条件

Product Size(bp) Min: Opt: Max:
Primer Size(bp) Min: Opt: Max:
Primer Tm(℃) Min: Opt: Max:
Primer GC% Min: Opt: Max:
Sequence Primer
検索条件
Primerから読み始めまでの距離(bp)
Primer間隔(bp)
Primer検索間隔(bp)

逆鎖のPrimerも検索

正鎖と逆鎖のPrimeのr間隔(bp)
Hybridization Probe
検索条件
Hyb Oligo Size(bp) Min: Opt: Max:
Hyb Oligo Tm (℃) Min: Opt: Max:
Hyb Oligo GC% Min: Opt: Max:
デザインするPrimer数:
forward primerの検索
(又は以下の配列を使用)

reverse primerの検索
(又は以下の配列を使用

hybridization probeの検索
(又は以下の配列を使用)

Primer位置から除外したい領域の指定(省略化)
 > 記入例:「68bpからの20bp、401bpからの7bp」=「68,3 401,7」
Primerに含めたい領域の指定(省略化)
 ] 記入例:「51bpから53bpの3bp」=「51,3」
PCR産物に含めたい領域(省略化)
 } 記入例:「50bpからの400bp」=「50,400」




結果表示数、配列表示数、期待値
塩基配列DBの選択
ヒト 霊長類 齧歯類 哺乳類 脊椎動物 無脊椎動物
植物 バクテリア ウィルス ファージ 未注釈データ GSS
HTG 特許データ STS 合成配列 HTC ENV




スコアの閾値 (省略時:85.0):
転写因子結合配列DBの選択
全て 脊椎動物 節足動物 植物 酵母


Average Monoisotopic




Animal Plant Fungi


E-value cutoff level: 


結果表示数 、 配列表示数 、 期待値
アミノ酸配列DBの選択
アミノ酸配列デフォルトデータ (UniProt + PRF + PDB)
UniProt (UniProt/Swiss-Prot + UniProt/TrEMBL)
UniProt/Swiss-Prot UniProt/TrEMBL DAD
PRF PDB C.elegans 全蛋白




構造の予測:


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